Më 9 gusht 1945 - "Fat Man", një bombë plutoniumi e vendosur në aeroplanin bombardues amerikan B-29, Bockscar, ishte planifikuar për ‘u lëshuar nga ajri në qytetin japonez Kokura - tre ditë pasi Shteteve e Bashkuara kishin hedhur një bombë atomike shkatërruese në Hiroshima.

Moti ishte i vrenjtur dhe shikueshmëria e dobët, kështu piloti zgjodhi objektivin më të afërt, Nagasakin.

Ashtu si me vlerësimet e vdekjeve në Hiroshima, nuk do të dihet kurrë me siguri se sa njerëz vdiqën si rezultat i sulmit atomik në Nagasaki. Vlerësimi më i mirë është se 40,000 njerëz vdiqën menjëherë dhe 60,000 të tjerë mbetën të plagosur. Deri në janar të vitit 1946, numri i vdekjeve ndoshta iu afrua 70,000, me ndoshta dyfishin e numrit total të të vdekurve brenda pesë viteve. Për ato zona të Nagasaki të prekura nga shpërthimi, shkalla e vdekjeve ishte e krahasueshme me atë në Hiroshima.

Pas shpërthimit, zjarre të shumta dytësore shpërthyen në të gjithë qytetin. Përpjekjet për shuarjen e zjarrit u penguan nga prishjet e linjës së ujit dhe gjashtë javë më vonë qyteti ende vuante nga mungesa e ujit. Një oficer i marinës amerikane që vizitoi qytetin në mes të shtatorit raportoi se, edhe më shumë se një muaj pas sulmit, "një erë vdekjeje dhe korrupsioni përshkon vendin". Ashtu si në Hiroshima, efektet psikologjike të sulmit ishin padyshim të konsiderueshme.

Një ditë pas sulmit në Nagasaki, perandori i Japonisë përmbysi udhëheqësit ushtarakë të Japonisë dhe i detyroi ata të ofronin të dorëzoheshin (pothuajse) pa kushte. Bomba "Fat Man" shkatërroi më shumë se gjysmën e Nagasakit dhe Japonia u dorëzua pa kushte të nesërmen.